Submitted SNP(ss) Details: ss103599959

Submitted SNP(ss) Details: ss103599959

Submitter
Handle	BCMHGSC_JDW
Submitter SNP ID	JWB-4057934
RefSNP(rs#)	rs80082376
Submitted Batch ID	JWB_snps_indel
Submitted Date	Jun 06, 2008
Publication Cited	[1] The Complete Genome of a Single Individual by Massively Parallel DNA Sequencing
First entry to dbSNP	Jun 6 2008 12:00:00:000AM

Resource Links
Submitted Gene Name	N.D
Submitted Gene ID	N.D.
Submitted SNP Synonyms	N.D
Submitted linkout	N.D

Assay
Species	Homo sapiens
Molecular Type	Genomic
Method	JWB_SNP_DISCOVERY
Ascertainment Samplesize	2
Population	N.D.

Allele
Observed Allele	-/(36922 BP INDEL)
Ancestral Allele	N.D.
Allele Origin	N/A
SNP Class	Named
CpG Code	N.D.

Validation
Validation Status	Not Validated
HWE Goodness of Fit	not applicable

Variation
Frequency Submission	N.D.
Genotype Summary	N.D.
Genotype Submission	N.D.
Haplotype	N.D.

Comment

ID = JWB-4057934 | Chromosome = chr17 | Start = 62003453 | End = 62040374 | strand = + |observed = CTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGGGTCTTGCTCTTTAACCCAGGCTGGAGTCCAGTGGTGCGATCTTGGCTCACTGCAGCCTCCACCTCCCGGGCTCAGGTGATCCTCCCACCCCAGCCTCCCAAGTAGCTGGCACTGCAGACGATGCACCACCAGCTAAGTTTTGTATTTTTGGTAGAGACGGGGTTTGGCCATGTTGCCCAGGCTGGTCTTGAACTTCTGGGCTGAAGCGATCTGCCTGCCTCTGCCTCTCAGAGTGCTGGGATTACAGGTATGAGCCACCGTGCCTGGCCCTGTGATGCACTTTTAATCACAGCGGTATTTGGTCAAAGGATGGCAGAATAACTAGGCTTGTGGGCTAGGGAGCATCCAGGAGGGACACCTGGTCTTCCGTGAGAGTCCGGCGATGGGGATCTTTGCATCCCTCTCTCACATTGGTCAAGGCCTCATTTCTACTCCTGATGTCTACTCCTGATTTGGGCCTGAGAGGTGCGAGCTCCCTTTCCAGAGTAGAATAAGCAGATGGTGATTCTGAGCAATGTGGGATGTGGACTGCAGCCTGGGCAAGGGAGTCCCTTGAGATGAGTCCTCCATAGCAGCCAGGATGCCACCCTGACTTCTGGCTCTCCTGACTCAGTCCACTTTTAGTCTCTTTTTCTGCAGGCCATGAAATAGCTCAGCCCCTGGCCTGCTTCAGACCTAGAGCTCAGCCAGCCTGCACTTCGGCTCTGGTTACGTCTTGGAGATCTGCTCTGTTTCTAGCCCAGGGAGGTGCGTAGTTTATATGGAAGTGAACTATATCTTTTTAAAAATACATTTCCTTCTTTTCTTTTTTATTGCGTCCATGTATTTAGAGCTAAAGGAGAGGTCCACAGCATGAGTTTATACTTCACCTTAGCCAGAAGTCCCTGCCACATTTATCCTTAGATCAGAGAATGACACTGGAGTGAGGACGGGGTAGTGGGGGGTAGGGAGTGGGGTGCTGCCCTAGCCTGTTCCCAGATGCTGCATAAGTCATCGTTTTCAATCCTGCATGCTTAGCTTCCGACCCCTGTCACCCTGCCACCCCCTCAGAAGCTGCCGCACACCTGCTCTGTGCCATGGACCAGCCAGAGTGCAGGGTTTGTGTCATGCGCCCCCTCCACCCCGTGAGCTCTTTCTTTAACCTTTCTCCTGCAACTCCTCCTCAGCCCCCTTTGAAATGCCAAATTCAGAAGCTGTGTTTCCCTTCCTCAGCCAGCTAACGAGAGACTGAATTTAAAACAAAACAAAACAAAACAAAACAGCCCTCATTGTCTCCCTTTGATATTTGCCTTTCATCTCGTCTGTCCCAGGGTCGGGGCATCCACCTAGGCCAGCACTCTGGAAAGACGCCTCACCTGCAGCAGGTAGAGCCCAGCAAGTCGGTCCAGGCTTCCGCACATGGTCATGTCCCCATGGGTTTGTCCACATGGGTTTGTTTGTCCTTGGAAACCCTTCAGCTCCAGGGAGCCTGAAGTCCTTGGCGAAGGATAAAGTGGAAGGGGAATGCAGCATGAGGGAGTCTTTCTGTTCATATTCACCACCTGAAAATTACAATGGTTCAAGCAGTGCACCTTCTAGACGAGGTGGTCTCAGCAAGCCTTAAAACCATCTGGTCAACAAGAGCAAAACATGTATAAGGCCATGAATGTACCTGGGGCTGGTTTGGTTTGGTTTGCACAAACCACCCCCTCCTCTGAGTGATGTATAAATAAGAAAGTAAACCCATCTCCCTGCCAAGTCATTCTAAAGAAGTAGCCCTGTCTTGGATGCCCATGTTTGTCTTCCACACCCTTTAGTGTAGAAGACATCAGGGCCCACCTCTGCATCCTGGGCCTGTGGTTCCTGTCCTCTTCATCCAGATCTGTGACTGTCGTGATAGTGTCCTAACTGACCGCCTGTCTCTCTGGTCTTGTGCCTCCTCCCAGCCGTCCTCGGGCCCCCTTGCACTGTGGATCACGTCCCCATGCCGACACTCATCTGTTTCGACCTGTGGGTGGCTCCCCGCGCAGCTCGCCAGGCAGGCCTCTGTGAACTGACTCTGAGAGTGCTCTCTGGCCCCACCGTTGCTTCTCACCTCTGCACTTGCAAGAGGCTACTTGTGCTTCTGTGCAGGCTGTGGCCTCTTGGGGCTCCCTGCATCTGTGGTGGCTGCTGCTTTCTGCTCGGAGCATGTGCACATGTGCGTTCCCTAGTCAGTACACAGTCAGCCCCTGCTGTGGCGCTGGCACACAGCAGAGAGCAAGAGAAGTGGCTTTGCCCCCCATTGAACAGACAGAGTAGTAGGGAAGACAGACATCAAGCTAGTCATCACGACCATAATTACGTAATTACCCTTTGTGACAAGAGCTGTGAAGTGGCAGGAAGGAAGCAGACCAGGGTCAAGGATGGCCTTCCTGTGGTGTGATGTGTAAGCTGGAATTTGGGTAGGAAATAGGTGGAGAAAGAGCCTGAAGAAAGATGTTTCCGGAACCTGCGATCAAGATGTGTGAAAGTCGTGATGGGAAAATGAGGATGACGGTAGCAGTGGGTAGGGGTCAGAGGTCACGCTTACCAAGGGTTTACCGTGTCAGGCACGGGTCTGTGTTACCTCATCACGTCCTCATACGACACTGCAAGAAAGGTGCTTTTACCATCCCCACTGCACACATGTGAAAACTGAGGCACAGAGAGGCCAGTGGGCATGCCTGAGCTCACGTGGCTGGTAGGGTGGTGGGATTTGGACCCAGGTAGTCTGGGTCCCGGGATCAAGCTGCAGTCACTGCAGCATCTTGCTGGGACCTTGAAAGAGGCCTTTGTGACTGGAACTGAAACCAGGGAGCTAAGGCTGGAAGGCAGAGGCAGGGCCATGGAGATGGTTTAGGAAGTGAGTGATGAAATTTGGATTTTTATGTGATCAGACTTGGTTGGGAGGACAGTGGATTGAAGGAGAGGCAAGGGAAGGAGGCAGAGAGAGGAATTATACACCGAAGGTTAAAAAAAAAATCGGGGGTTGGACTTCCCTCCTTCTTTCACTTGGTGCTTTCTCCTTGCCCTTCAAGACCTGGTGCAGGTGTCACTCTCTCTCCTCGGCTCACTCTCTTTCTCTGCGCCGGAGATCCTCAAGATCAGGGGAGATGTCTCGGCATCTCTCAGGGTTCCTCATGCACAGGCGGCTTTCCACAAATAAATGAAAGGAATGGAGGGAAAATAGTTACAAAGCTAAGAAGCAAGATGTTTCATTGGGTAATTTAACTTTTCAAGTTCATAACTCTGATGTGACTTTCACAGTGTAAGCTGCCTGTGGCTGATACTTTACTCATGGAGTACTAGTGGTCTGTTATTCAAGCTAAAATTTCCATTTCCTTATTAGCCTGAGTGACCAGCATTACTCCCCTAGCTCCACATTCTTAGGGAGTCAAGAGGTCGCTTTCAGCAGGCCAATCTGTGCACGACCTGCTGGTGCTGCAGCATTCCTTACTCAGATCTCAGAGACCCTGGGATTTTGCAGTGCTTTGGAAAGCTGACAGGGCTGGCACTGGGGGCTGGCTGGGATGGGAACAGGCTGCCCCTCTTGGCTCTCCATATAGGCCTGAGAGCCACGTGGTCCCACATGAGACACTGAGCCATGTTTGGGCTCCGCCTCCAGGGTTCCACGCATTCTTAGCATCTCAGCAATCCAAGGACAAACACATCAGCTTCCCCGTAGCTAAACATAAGAAAGTTGTCCGTGTTTTTATATAAACTTTACTGACATTTAAACATGCATACTTCATGAAAAGTGCAATATTGTCAGTGTGCGGTAAAGTGGGTTTTCGCCAACTAAACACACTTATGATCAAAACATGCCCGGATTTGCACCCAGATCAGGAAACAGAACATGACGCCACCCTGCGCCCTTCTTGCTTCCCTTCTGTTTACTGCACTCCTCGTGAAGGTAACCTTTGTCATCGCTTCTAACAGCCTGGATTAATTTTGCCTGTTTTTTGGGCTTTCTACCAATGGGATCATACAATGTGTAGAGAGGATGTAGGTTTAAGATGAGATTTGTTGCCCCCCCCCATGCTCGATTTATCCCATGTTCCTAGAAATTATAGAGATAACACAAGTGGAAAGACAGTCTCACAGTCTCATGACAGGAAGGTTACCCATCCGGGGTCAAACCATGCTTGGCACAGAGCCACTTGTTAGGATTCAGCAGTAATTAAAATGACTGTGTTGTTTATAAATTGTTTTATGAGTGCATTAGTGCCTTGTTTATTTTTTATCACCAGAGAAAGAGTGATCCTCCTAAGTAAATGTTCTAGATCAGTTGAGAAAGCAAACTTTCTCAGCCAAGGGCCAGCTAGTAAATATTTTTGGCTTTGCAGGCGCATATGGTCTTCGTTGCAACCACTCAATTCTGCTCTTGGGATGCAAAAGCTGTCTTGGACAATATATGCACAAATGAGGCTGGCTGTGCTCCAAAAAAGCTCCATTTGTGGACATTCAAATAGGAAGTTCACATAATTTTCACTTGTCACAAAATATTATTCTTCCAACTTTTTAAACTTGAACCATATTTGAGAGGGAATCTTTCTGAAGTGTTTTGTTTTTTCTTTTTTGTTTTTTGTTTTTGAGACAGAGTCTCTCTCTGTCCCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAATCTTGGCTCACTGCACCCTCTGCCTCCTGGGTTCATGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCATGTAGCTGGGACTACAGGCACCCGCCACCACGCCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAATAGAGATAGGGTTTCACCGTTTTAGCCAGGATGGTCTCAATCTCCTAACCTCGTGATCTGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGTGCCCGGCCATCTTTCTGAAGTTTTTAAACACTGATCTAAATTCTCAGGATGAGCTGAGAACATTTTCTTAGTAAATATGGGCAACATGGTTTAATAAAACATGGAA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Fasta sequence (Legend)

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 GATTTATGTG TTCGCTGTCT CTCATTTCTG TTCTCAAACC CTTGTTTTCT CCGTGGAAAA
 TGGTGATGTA
 N
 TTTTTTTTTT TGAGACAGAG TCTTGCTCTG TCACCCAAGC TGTAGTGGCA CGATCTCTGC
 TCACTGTAAC CTTCACCTCC CAGATTGAAG GGATTCTTGT GCCTCAGCCT CCCTAGTAGC
 TAGGACTACA GGTGTGCACC ATCACACCCA GCTAATTTTT GTATTTTTGT ATTTTCAGTA
 GAGATGGGGT TTCACCAAGA TGGCCAGGCT TGTCTTGAAC TCCTGGCTTC AAGTGATCTG
 TGTGCCTTGG

Submitted Frequency for ss103599959

There is no frequency submission for ss103599959.

dbSNP summary of Genotypes for ss103599959

No sufficient data to compute Hardy-weinberg probability for ss103599959.

Submitted individual genotype for ss103599959

There is no individual genotype data for ss103599959.

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