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Cytogenetic Resource of FISH-mapped, Sequence-tagged Clones


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Chr clone name Distributor1 FISH Placement on genome2 Placement summary3 Insert sequence4 STS4 BAC-ends4 Flag
12 GS1-124K20 12pter(UChicago)
           
12 RP11-283I3 R 12p13.33d(NCI)
chr12 0Mb AC007406.1 D12S1256 CL423197.1 SP6,
CL423202.1 T7
 
12 CTB-10M21 R 12p13.3(CSMC)
      D12S364*u    
12 CTB-16F14 R 12p13.3(CSMC)
chr12 4Mb   D12S314    
12 CTB-4G5 R 12p13.3(CSMC)
chr12 5Mb   D12S93    
12 CTD-2058B1 C 12p13.3(FHCRC)
chr12 4Mb     AQ243928.1 SP6,
AQ242670.1*u T7
 
12 RP11-24N12 C 12p13.3(FHCRC)
chr12 2Mb   SHGC-32621 AQ013913.1 ,
B86726.1 SP6
 
12 RP11-359B12 CR 12p13.3(FHCRC)
12p13.33c~13.33d(NCI)
chr12 0Mb AC004803.11 D12S1913 AQ540644.1 T7,
AQ540642.1 SP6
 
12 RP11-74M9 C 12p13.3(FHCRC)
chr12 4Mb   SHGC-10951 AQ269006.1 SP6  
12 RP11-79K20 C 12p13.3(FHCRC)
chr12 1Mb     AQ581460.1 T7,
AQ283206.1 T7,
AQ283203.1 SP6,
AQ581456.1 SP6
 
12 RP11-110K11 C 12p13.2~13.3(FHCRC)
chr12 0Mb   SHGC-9936 AQ353758.1 SP6,
AQ318373.1 T7
 
12 RP11-91B13 C 12p13.2~13.3(FHCRC)
chr12 4Mb     AQ283232.1 SP6,
AQ283235.1 T7
 
12 RP11-166G2 C 12p13(FHCRC)
chr12 5Mb   SHGC-20727 AQ379998.1 SP6,
AQ380001.1*u T7
 
12 RP11-234J8 C 12p13(FHCRC)
           
12 RP11-264F23 C 12p13(FHCRC)
chr12 4Mb AC006122.24   AQ487351.1 T7  
12 RP11-272L6 C 12p13(FHCRC)
           
12 RP11-320N7 C 12p13(FHCRC)
chr12 3Mb AC007207.22      
12 RP11-467M14 C 12p13(FHCRC)
chr12 0Mb AC016741.7      
12 RP11-500M8 C 12p13(FHCRC)
chr12 4Mb AC005832.1      
12 RP11-69M1 C 12p13(FHCRC)
chr12 7Mb AC006511.5   AQ268341.1 T7,
AQ268340.1 SP6
 
12 RP11-88D16 C 12p13(FHCRC)
chr12 3Mb     AZ516149.1 SP6,
AZ516152.1 T7,
AQ286650.1 T7
 
12 RP11-90N7 CR 12p12.3~13(FHCRC)
12p13.2b(NCI)
chr12 11Mb     AQ284534.1 SP6,
AZ518608.1 T7,
AQ284535.1 T7
 
12 RP11-25K5 C 12p12~13(FHCRC)
chr12 48Mb AC079849.27 SHGC-33198 B82119.1 T7,
B82118.1 SP6
 
12 RP11-277P12 C 12p12~13(FHCRC)
chr12 10Mb AC022075.29   AQ505696.1 T7,
AQ505695.1 SP6
 
12 RP11-418C2 C 12p12~13(FHCRC)
chr12 11Mb AC084358.19   AQ555013.1 T7  
12 RP11-59H1 C 12p12~13(FHCRC)
chr12 12Mb AC007215.49 AA630082 AQ202594.1  
12 RP11-75L1 C 12p12~13(FHCRC)
chr12 9Mb AC007068.17   AQ268935.1 SP6,
AQ268936.1 T7
 
12 RP11-407G6 R 12p13.33a(NCI)
chr12 2Mb AC005866.4 D12S1443    
12 RP11-543P15 R 12p13.32b(NCI)
chr12 3Mb AC005912.1 D12S1626    
12 RP11-388F6 R 12p13.32a~13.32b(NCI)
chr12 4Mb AC008012.8 D12S1725    
12 RP11-319E16 R 12p13.32a(NCI)
chr12 5Mb AC006206.3 D12S93 AQ536899.1 T7,
AQ536898.1 SP6
 
12 RP11-451H11 R 12p13.31e~13.32a(NCI)
chr12 5Mb AC006431.9 D12S374 AQ585033.1 T7,
AQ585029.1 SP6
 
12 RP11-433J6 R 12p13.31c(NCI)
chr12 6Mb AC079387.1,
AC135892.1
  CL423328.1 T7,
CL423323.1 SP6
 
12 RP11-277E18 R 12p13.2c~13.31a(NCI)
chr12 7Mb AC007536.10 D12S397    
12 CTD-2007B13 C 12p13.2(FHCRC)
        AQ304885.1*u T7  
12 RP11-451M6 C 12p13.2(FHCRC)
chr12 6Mb     AQ584051.1 T7  
12 RP11-89B1 12p13.2(FHCRC)
chr12 9Mb     AQ283610.1 T7,
AQ283608.1 SP6
 
12 RP11-13C13 R 12p13.2b(NCI)
chr12 10Mb AC006510.8 AFM311VC1 AZ521024.1 SP6,
B73268.1 T7
 
12 RP11-144O23 R 12p13.2a(NCI)
chr12 10Mb AC006518.17 D12S841 AQ388065.1 T7  
12 RP11-4N23 R 12p13.1b(NCI)
chr12 13Mb AC007527.6 D12S320    
12 RP11-96K24 C 12p13.1(FHCRC)
chr12 13Mb   SHGC-2154 AQ313555.1 T7,
AQ313544.1 SP6
 
12 RP11-85G7 C 12p12.3~13.1(FHCRC)
chr12 18Mb   SHGC-8834 AQ281918.1 T7  
12 CTB-13N9 R 12p13.1~12(CSMC)
chr12 10Mb   AFM311VC1    
12 RP11-233G1 C 12p12~13.1(FHCRC)
chr12 14Mb AC007655.1      
12 RP11-502N13 R 12p13.1a(NCI)
chr12 14Mb AC008114.25 D12S308*d   multiple_placements_on_genome
12 RP11-502N13 R 12p13.1a(NCI)
chr12 14Mb AC008114.25*d D12S308   multiple_placements_on_genome
12 RP11-1018J8 R 12p12.3e(NCI)
chr12 15Mb AC007543.4 D12S62    
12 CTB-53N6 R 12p12.3(CSMC)
chr12 17Mb   D12S363    
12 RP11-174L5 C 12p12.3(FHCRC)
chr12 14Mb   SHGC-9278    
12 CTB-47J22 R 12p12(CSMC)
chr12 16Mb   AFMA065XE5    
12 CTD-2027F9 C 12p12(UCSF)
12p12.3(FHCRC)
        AQ773254.1*u SP6  
12 CTD-2168N10 R 12p12(UCSF)
chr12 0Mb     B94754.1 ,
AQ125866.1 T7,
B94755.1 SP6,
AQ105028.1 SP6
 
12 RP11-164B11 C 12p12(FHCRC)
chr12 15Mb AC092753.9   AQ379392.1 SP6,
AQ379394.1 T7
 
12 RP11-180M15 C 12p12(FHCRC)
chr12 12Mb AC008115.4   AQ415210.1 T7  
12 RP11-206D16 C 12p12(FHCRC)
chr12 18Mb   SHGC-15979 AQ422039.1 T7,
AQ421568.1 SP6
 
12 RP11-2D2 C 12p12(FHCRC)
chr5 34Mb   AFM238WE11, AFM238WE11*u B47742.1 T7,
AQ283471.1 SP6
 
12 RP11-319K17 C 12p12(FHCRC)
chr12 18Mb AC017041.4,
AC091815.7
     
12 RP11-320J20 C 12p12(FHCRC)
chr12 15Mb AC007542.3   AZ124139.1 ,
AZ124138.1*d
multiple_placements_on_genome
12 RP11-320J20 C 12p12(FHCRC)
chr12 16Mb AC007542.3*d   AZ124138.1 ,
AZ124139.1*d
multiple_placements_on_genome
12 RP11-49G2 C 12p12(FHCRC)
chr12 22Mb AC007671.7   AQ060594.1 ,
AQ051849.1
 
12 RP11-501E24 C 12p12(FHCRC)
chr12 21Mb AC006559.6      
12 RP11-64J22 C 12p12(FHCRC)
chr12 25Mb   SHGC-20743 AQ237016.1 SP6,
AQ237018.1*u T7
 
12 RP11-713N11 C 12p12(FHCRC)
chr12 25Mb AC023510.16      
12 RP11-80N2 C 12p12(FHCRC)
chr12 20Mb AC011604.10   AQ317823.1 SP6  
12 RP11-91B19 C 12p12(FHCRC)
chr12 20Mb     AQ283248.1 T7,
AQ283247.1 SP6
 
12 RP11-92H16 C 12p12(FHCRC)
chr12 21Mb AC010197.7   AQ281136.1 SP6,
AQ320843.1*u T7
 
12 RP11-283G6 C 12p11.2~12(FHCRC)
chr12 26Mb AC022509.21      
12 RP11-295I5 C 12p11.2~12(FHCRC)
chr12 25Mb AC092794.10, AC015704.3*u   AQ485346.1 SP6,
AQ485348.1 T7
 
12 RP11-489N6 R 12p12.3d(NCI)
chr12 15Mb AC018654.23 RH44647, RH52620 AQ634921.1 SP6  
12 RP11-69C13 R 12p12.3c(NCI)
chr12 16Mb AC007529.5 D12S1630 AQ267430.1 SP6,
AQ267433.1 T7
 
12 RP11-871F6 R 12p12.3b(NCI)
chr12 17Mb AC048352.18 D12S363 AQ792168.1 T7,
AZ124122.1
 
12 RP11-125O5 R 12p12.1e(NCI)
chr12 21Mb AC022335.8 D12S1085 AQ347539.1 SP6,
AZ081765.1 ,
AQ347541.1 T7
 
12 RP11-53C3 C 12p12.1(FHCRC)
chr12 26Mb   SHGC-12564 AQ052981.1  
12 RP11-64N21 C 12p12.1(FHCRC)
chr12 27Mb   SHGC-5947 AQ238738.1 T7,
AQ238737.1 SP6
 
12 CTA-391F7 R 12p12.1~11.2(CSMC)
chr12 26Mb   D12S1413    
12 RP11-729I10 R 12p12.1d~12.1c(NCI)
chr12 21Mb AC008250.23   AQ616697.1 SP6,
AQ616617.1 T7
 
12 RP11-12D15 R 12p12.1c(NCI)
chr12 22Mb AC007544.4 D12S1688, SHGC-12597 B75736.1 T7,
B75735.1 SP6
 
12 RP11-877E17 R 12p12.1b(NCI)
chr12 25Mb AC055707.33 D12S1034 AQ782762.1 T7,
AQ563037.1 SP6
 
12 RP11-666F17 R 12p11.23(NCI)
chr12 26Mb AC023051.21 D12S68    
12 CTB-10I9 R 12p11.2(CSMC)
chr12 27Mb   AFMB002XG5    
12 CTB-11G16 R 12p11.2(CSMC)
chr12 29Mb   D12S333    
12 CTB-9L19 R 12p11.2(CSMC)
chr12 29Mb   EST142991    
12 RP11-100P18 C 12p11.2(FHCRC)
chr12 30Mb   SHGC-246 AQ311792.1 T7,
AQ345741.1 SP6
 
12 RP11-38F11 C 12p11.2(FHCRC)
chr12 32Mb   SHGC-9423    
12 RP11-56J24 C 12p11.2(FHCRC)
chr12 31Mb   SHGC-1349, SHGC-1349*u AQ115269.1 ,
AQ082477.1
 
12 RP11-73I12 C 12p11.2(FHCRC)
chr12 31Mb   SHGC-2727 AQ285996.1 T7,
AQ268949.1 SP6
 
12 RP11-74J4 C 12p11.2(FHCRC)
chr12 27Mb   SHGC-12814, SHGC-12472 AQ267856.1 T7  
12 RP11-78F16 C 12p11.2(FHCRC)
chr12 30Mb   SHGC-8741 AQ281242.1 T7  
12 RP11-89L4 C 12p11.2(FHCRC)
chr12 26Mb     AQ286579.1 T7,
AQ286577.1*u SP6
 
12 RP11-90H7 C 12p11.2(FHCRC)
chr12 30Mb     AQ284275.1 SP6,
AZ518471.1 T7,
AQ284278.1 T7
 
12 RP11-90K13 C 12p11.2(FHCRC)
chr12 30Mb     AQ283499.1 SP6,
AQ283502.1 T7
 
12 RP11-88P4 C 12p11.1~11.2(FHCRC)
chr12 33Mb     AZ516902.1 SP6,
AQ286868.1 SP6,
AZ516904.1 T7
 
12 RP11-8P13 C 12p11.1~11.2(FHCRC)
chr12 32Mb AC019269.4,
AC087588.10
AA056381 B72460.1 SP6,
B72461.1 T7
 
12 RP11-91O8 12p11.1~11.2(FHCRC)
chr12 32Mb     AQ282786.1 SP6,
AQ282789.1 T7
 
12 RP11-1060J15 R 12p11.22b(NCI)
chr12 27Mb AC009509.7 WI-20340    
12 RP11-449D5 C 12p11.22(FHCRC)
chr12 29Mb     AQ584297.1 T7,
AQ584293.1*u SP6
 
12 RP11-485K18 R 12p11.22a~11.22b(NCI)
chr12 28Mb AC024939.24 B847A19/T7 AQ633254.1 SP6  
12 RP11-780A5 R 12p11.22a(NCI)
chr12 29Mb AC023281.13 D12S290 AQ461552.1 T7,
AQ495198.1 SP6
 
12 RP11-517B23 R 12p11.21b~11.22a(NCI)
chr12 31Mb AC011324.24 WI-21216 CL423301.1 SP6,
CL423306.1 T7
 
12 RP11-956A19 R 12p11.21a(NCI)
chr12 32Mb AC016954.43 D12S345*u CL423334.1 SP6,
AZ124118.1
 
Chr clone name Distributor1 FISH Placement on genome2 Placement summary3 Insert sequence4 STS4 BAC-ends4 Flag
12 RP11-460N10 R 12p11.1a(NCI)
chr12 33Mb AC021070.24 D12S1307    
12 RP1-28I3 S 12cen(SC)
      sWXD1207*u    
12 RP11-496H24 R 12q11(NCI)
chr12 36Mb AC020654.23,
AC090623.4
D12S1931    
12 RP11-152M7 R 12q11~12(NCI)
chr12 37Mb AC069442.33 D12S331 AQ380395.1 SP6,
AQ380396.1 T7
 
12 RP11-503D9 R 12q12a~12b(NCI)
chr12 38Mb AC016150.19 D12S1469, D12S1469*u    
12 CTB-14D9 R 12q12(CSMC)
chr12 46Mb   EST105129    
12 CTB-49I6 R 12q12(CSMC)
chr12 52Mb   AFMA224YG1    
12 CTB-51F5 R 12q12(CSMC)
chr12 49Mb   D12S361    
12 RP11-29G23 C 12q12(FHCRC)
chr12 43Mb   SHGC-33633    
12 RP11-499A10 C 12q12(FHCRC)
chr12 43Mb AC025253.20      
12 RP11-88L2 C 12q12(FHCRC)
chr12 42Mb     AQ281030.1 SP6,
AZ516831.1 T7,
AQ281032.1 T7
 
12 RP11-90I21 C 12q12(FHCRC)
chr12 41Mb     AQ281806.1 SP6,
AQ281808.1 T7
 
12 RP11-91A7 C 12q12(FHCRC)
chr12 42Mb     AQ286300.1 SP6,
AQ286302.1 T7
 
12 RP11-91K15 C 12q12(FHCRC)
chr12 39Mb     AQ281539.1 SP6,
AQ281541.1 T7
 
12 RP11-426E10 S 12q12~13.13(SC)
chr12 53Mb   RH25537*u AZ916648.1 SP6,
AZ694812.1 T7,
AQ528907.1*u SP6
 
12 CTD-2043O8 C 12q12~13(FHCRC)
           
12 RP11-112N23 C 12q12~13(FHCRC)
chr12 49Mb AC090058.21   AQ343353.1 T7  
12 RP11-270J9 C 12q12~13(FHCRC)
chr12 47Mb     AQ480656.1 SP6  
12 RP11-302B13 C 12q12~13(FHCRC)
chr12 47Mb AC073610.17      
12 RP11-438E8 C 12q12~13(FHCRC)
chr12 43Mb AC063924.17      
12 RP11-449D15 C 12q12~13(FHCRC)
chr12 46Mb     AQ584329.1 T7,
AQ584325.1*u SP6
 
12 RP11-480H15 R 12q12~13(FHCRC)
12q13.11b(NCI)
chr12 47Mb AC009775.29 7600 CL423240.1 T7,
AQ635619.1 T7,
AZ124156.1
 
12 RP11-533J15 C 12q12~13(FHCRC)
chr12 49Mb AC009727.11      
12 RP11-551G13 C 12q12~13(FHCRC)
chr12 44Mb AC010172.21      
12 RP11-62K10 C 12q12~13(FHCRC)
chr12 48Mb     AQ200834.1  
12 RP11-79K1 C 12q12~13(FHCRC)
chr12 45Mb     AQ283739.1 T7,
AZ519074.1 SP6,
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B53124.1
 
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chr12 50Mb AC021066.37   AQ813484.1 SP6,
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chr12 46Mb AC121338.6   AQ284725.1 SP6,
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12 RP11-91L17 C 12q13(FHCRC)
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12 RP11-145A4 C 12q13~14(FHCRC)
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12 RP11-39G24 C 12q13~14(FHCRC)
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AQ030065.1 T7
 
12 RP11-91I15 C 12q13~14(FHCRC)
chr12 54Mb     AQ281464.1 SP6,
AQ281467.1 T7
 
12 RP11-968A15 C 12q13~14(FHCRC)
chr12 52Mb AC078778.34   AQ606045.1 T7  
12 RP11-1100L3 R 12q13.13c~13.13d(NCI)
chr12 50Mb AC025259.49 D12S1712 AQ719509.1*u SP6  
12 RP11-624J6 R 12q13.13e(NCI)
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12 RP11-972K6 R 12q13.13f(NCI)
chr12 52Mb AC073594.31 D12S325 AQ801474.1*u T7  
12 CTB-184K20 12q13.2(UCSF)
           
12 CTD-2098N12 R 12q13.2(UCSF)
           
12 RP11-101H10 C 12q13.2(FHCRC)
chr12 52Mb   SHGC-37389*u, AFMA131WB9*u, AFMA131WB9*u, SHGC-37389*u AQ321394.1 T7,
AQ321391.1 SP6
 
12 RP11-112M10 C 12q13.2(FHCRC)
chr12 49Mb   SHGC-10833, 36492*u AQ312320.1 T7  
12 RP11-88M8 C 12q13.2(FHCRC)
chr12 50Mb   SHGC-2157 AQ285915.1 SP6  
12 RP11-97N16 C 12q13.2~13.3(FHCRC)
chr12 51Mb   SHGC-9890 AQ315572.1 SP6  
12 CTD-2241M16 C 12q13.2(UCSF)
12q14(FHCRC)
chr12 56Mb     AQ065748.1 T7,
AQ457099.1*u SP6
 
12 RP11-681G7 R 12q13.2b~13.2c(NCI)
chr12 53Mb AC025570.43 D12S1724 AQ518287.1 SP6,
AQ610367.1*u T7
 
12 RP11-973D8 R 12q13.2c~13.3a(NCI)
chr12 54Mb AC025162.48 D12S1978 AQ606971.1*u T7,
AQ714003.1*u SP6
 
12 RP11-183H16 R 12q13.3a(NCI)
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12 CTB-22A15 R 12q13.3(CSMC)
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12 CTD-2042H22 C 12q13.3(FHCRC)
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B80088.1
 
12 RP11-799O6 R 12q13.3a~13.3b(NCI)
chr12 55Mb AC023499.11 D12S1644 AQ515592.1*u SP6,
AQ523007.1*u T7
 
12 RP11-276L24 C 12q14.1(FHCRC)
chr12 59Mb   SHGC-222    
12 CTA-394A5 R 12q14(CSMC)
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12 CTB-44I17 R 12q14(CSMC)
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12 RP11-263K23 C 12q14(FHCRC)
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AQ482287.1 T7
 
12 RP11-35G5 C 12q14(FHCRC)
chr12 58Mb   SHGC-17526 AQ046431.1 ,
AQ046429.1
 
12 RP11-418I17 C 12q14(FHCRC)
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AC090439.8
     
12 RP11-571M6 C 12q14(FHCRC)
chr12 56Mb AC025165.27, AC023375.2*u RH53014*u    
12 RP11-61P1 C 12q14(FHCRC)
chr12 61Mb   SHGC-2127 AQ196189.1  
12 RP11-80D18 C 12q14(FHCRC)
chr12 60Mb     AQ283984.1 T7,
AQ283982.1 SP6
 
12 RP11-863H1 C 12q14(FHCRC)
chr12 60Mb AC079035.46      
12 RP11-88F18 C 12q14(FHCRC)
chr12 60Mb     AZ516197.1 SP6,
AQ286723.1 T7,
AZ516199.1 T7
 
12 RP11-88F24 C 12q14(FHCRC)
chr12 60Mb     AQ286752.1 T7,
AZ516218.1 T7,
AQ286738.1 SP6
 
12 RP11-90P21 C 12q14(FHCRC)
chr12 58Mb     AQ285270.1 SP6,
AZ518686.1 T7,
AQ285272.1 T7
 
12 RP11-91H3 C 12q14(FHCRC)
chr12 60Mb     AQ283380.1 T7  
12 RP11-97A6 C 12q14(FHCRC)
chr12 60Mb   SHGC-15985 AQ317724.1 T7,
AQ317721.1 SP6
 
12 CTB-4G8 R 12q14~15(CSMC)
chr12 69Mb   AFMA082ZB5    
12 CTB-4H7 R 12q14~15(CSMC)
chr12 69Mb   AFMA082ZB5    
12 RP11-196H14 C 12q14~15(FHCRC)
chr12 62Mb AC025576.26 SHGC-32073 AQ415062.1 SP6,
AQ415064.1 T7
 
12 RP11-220L3 C 12q14~15(FHCRC)
chr12 63Mb AC068795.25 SHGC-34784, SHGC-15985*d   multiple_placements_on_genome
12 RP11-220L3 C 12q14~15(FHCRC)
chr12 60Mb AC068795.25*d SHGC-15985, SHGC-34784*d   multiple_placements_on_genome
12 RP11-247H13 C 12q14~15(FHCRC)
        AQ489279.1*u T7  
12 RP11-254B13 C 12q14~15(FHCRC)
chr12 67Mb AC015550.19   AQ479162.1*d SP6 multiple_placements_on_genome
Chr clone name Distributor1 FISH Placement on genome2 Placement summary3 Insert sequence4 STS4 BAC-ends4 Flag
12 RP11-254B13 C 12q14~15(FHCRC)
chr12 22Mb AC015550.19*d   AQ479162.1 SP6 multiple_placements_on_genome
12 RP11-91K23 C 12q14~15(FHCRC)
chr12 65Mb     AZ518707.1 T7,
AQ318740.1 SP6
 
12 RP11-557F20 R 12q14.1b(NCI)
chr12 57Mb AC068305.30 D12S355    
12 RP11-631N16 R 12q14.1d(NCI)
chr12 61Mb AC048341.22 D12S329 AQ407942.1 T7,
AQ442972.1 SP6
 
12 RP11-1022B3 R 12q14.1d~14.2a(NCI)
chr12 61Mb AC026116.26 WI-1079 AQ821793.1*u SP6  
12 RP11-596J18 R 12q14.2(NCI)
chr12 63Mb AC022510.34 AFMA108WE1 CL423300.1 SP6,
CL423305.1 T7
 
12 RP11-512G13 R 12q14.3c(NCI)
chr12 65Mb AC012518.19 D12S868 CL423333.1 SP6,
CL423338.1 T7
 
12 CTA-399E3 R 12q15(CSMC)
chr12 68Mb   D12S1417    
12 CTB-11B7 R 12q15(CSMC)
chr12 75Mb   D12S350    
12 CTB-1E16 R 12q15(CSMC)
chr12 75Mb   D12S350, AFM302WB9*u    
12 RP11-109L8 C 12q15(FHCRC)
chr12 65Mb   SHGC-34947    
12 RP11-16M7 C 12q15(FHCRC)
chr12 63Mb AC022189.2*u SHGC-35771 B75511.1 T7,
B75510.1 SP6
 
12 RP11-18B8 C 12q15(FHCRC)
chr12 63Mb   SHGC-36877 B81892.1 T7  
12 RP11-5J6 C 12q15(FHCRC)
chr12 66Mb   SHGC-3797 AZ516942.1 SP6,
B69652.1 T7,
B48149.1 T7
 
12 RP11-90G3 C 12q15(FHCRC)
chr12 69Mb     AQ281569.1 SP6,
AQ281572.1 T7
 
12 RP11-15L3 C 12q15~21.1(FHCRC)
chr12 68Mb   SHGC-33073 B75363.1 SP6,
B75364.1 T7
 
12 RP11-184C7 C 12q15~21.1(FHCRC)
chr12 65Mb   SHGC-5883 AQ419617.1 T7,
AQ419614.1 SP6
 
12 RP11-127J23 CR 12q15~21(FHCRC)
12q21.31a(NCI)
chr12 79Mb AC068798.26 D12S1297    
12 RP11-89M22 C 12q15~21(FHCRC)
chr12 70Mb AC090109.15   AQ283520.1 SP6,
AQ283523.1 T7
 
12 RP11-1143G9 R 12q15b~15c(NCI)
chr12 67Mb AC020656.33 D12S1417 AQ699365.1 SP6,
AZ124178.1
 
12 RP11-1022D13 R 12q15c(NCI)
chr12 68Mb AC016153.21 WI-17013 CL423268.1 SP6,
CL423273.1 T7
 
12 RP11-1007B5 R 12q15d(NCI)
chr12 69Mb AC015544.19 AFMA082ZB5    
12 RP11-691B3 R 12q15d~21.1a(NCI)
chr12 70Mb AC012018.24 WI-13774    
12 RP11-56G10 C 12q21.1(FHCRC)
chr12 73Mb AC025257.22 SHGC-12127 AQ083454.1*d ,
AQ083456.1*d
multiple_placements_on_genome
12 RP11-56G10 C 12q21.1(FHCRC)
chr8 113Mb AC025257.22*d SHGC-12127*d AQ083454.1 ,
AQ083456.1
multiple_placements_on_genome
12 RP11-81H3 C 12q21.1(FHCRC)
chr12 72Mb AC128678.8   AQ281590.1 SP6,
AZ521585.1 SP6,
AZ521586.1 T7,
AQ281591.1 T7
 
12 RP11-89P15 C 12q21.1(FHCRC)
chr12 70Mb     AQ285651.1 SP6,
AZ517843.1 T7,
AQ285653.1 T7
 
12 RP11-934P3 C 12q21.1(FHCRC)
chr12 69Mb AC025575.21   AQ666130.1*u T7  
12 RP11-96F19 C 12q21.1~21.2(FHCRC)
chr12 75Mb   SHGC-2142*u AQ314163.1 SP6,
AQ314164.1 T7
 
12 RP11-121G22 C 12q21(FHCRC)
chr12 80Mb AC078920.17 H08850 AQ343666.1 T7,
AQ343665.1 SP6
 
12 RP11-25J3 C 12q21(FHCRC)
chr12 74Mb AC022507.26 AA251800 AQ013613.1 ,
B82110.1 T7,
B82109.1*u SP6
 
12 RP11-90C1 C 12q21(FHCRC)
chr12 77Mb AC130415.4   AQ281420.1 T7,
AQ281412.1 SP6
 
12 RP11-91C4 C 12q21(FHCRC)
chr12 82Mb     AQ283726.1 T7,
AQ283722.1 SP6
 
12 RP11-91I24 C 12q21(FHCRC)
chr12 82Mb AC127891.2   AQ282598.1 SP6,
AQ282600.1 T7
 
12 RP11-92P22 C 12q21(FHCRC)
chr12 74Mb   SHGC-35465*u AZ124191.1 ,
AQ282030.1 SP6,
AQ320866.1 T7
 
12 RP11-1060G2 C 12q21~22(FHCRC)
chr12 92Mb AC012464.25   AQ833114.1 T7,
AQ816069.1*u SP6
 
12 RP11-796E2 C 12q21~22(FHCRC)
chr12 90Mb AC025164.37   AQ710220.1 T7,
AQ500044.1*u SP6
 
12 RP11-255I14 R 12q21.1c(NCI)
chr12 73Mb AC021648.25 G64768    
12 RP11-148D15 R 12q21.2(NCI)
chr12 76Mb AC073652.15   AQ375656.1 SP6,
AQ375658.1 T7
 
12 RP11-230I13 C 12q21.2(FHCRC)
chr12 78Mb   SHGC-12854 AQ489534.1 SP6,
AQ489536.1 T7
 
12 RP11-530C5 R 12q21.2~21.31(NCI)
chr12 78Mb AC073569.26 WI-16785    
12 RP11-114G18 C 12q21.31(FHCRC)
chr12 80Mb   SHGC-1053 AQ346368.1 T7,
AQ346365.1 SP6
 
12 CTB-10P6 R 12q21.3(CSMC)
chr12 80Mb   D12S106    
12 CTB-56K2 R 12q21.3(CSMC)
chr12 83Mb   D12S323    
12 CTB-8P1 R 12q21.3(CSMC)
chr12 84Mb   D12S81    
12 CTD-2017D5 C 12q21.3(FHCRC)
chr12 88Mb     AQ227362.1 SP6,
AQ227203.1 T7
 
12 CTD-2101J13 C 12q21.3(FHCRC)
chr12 87Mb   Hs.1048    
12 RP11-272A1 C 12q21.3(FHCRC)
      AFMA050TD5*u    
12 RP11-451C10 12q21.3(FHCRC)
           
12 RP11-79B17 C 12q21.3(FHCRC)
chr12 85Mb     AQ284040.1 SP6,
AQ284043.1 T7
 
12 RP11-80B4 C 12q21.3(FHCRC)
chr12 79Mb     AQ283225.1 SP6,
AQ283228.1 T7
 
12 RP11-81H17 C 12q21.3(FHCRC)
chr12 88Mb     AZ521608.1 T7,
AQ281618.1 T7,
AZ521607.1 SP6,
AQ286893.1 SP6
 
12 RP11-823E8 C 12q21.3(FHCRC)
chr12 88Mb AC024909.28      
12 RP11-82I16 C 12q21.3(FHCRC)
chr12 92Mb   SHGC-33476    
12 RP11-88N10 C 12q21.3(FHCRC)
chr12 86Mb     AZ516874.1 T7,
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12 RP11-981P6 C 12q21.3(FHCRC)
chr12 88Mb AC068641.18      
12 CTB-60B1 R 12q21.3~22(CSMC)
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chr12 91Mb   SHGC-6445 AQ387427.1 SP6,
AQ387430.1*u T7
 
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chr12 91Mb   SHGC-11785 AQ379935.1 SP6,
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AQ597420.1*u T7
 
12 RP11-215G13 C 12q22~23(FHCRC)
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AZ521536.1 T7,
AQ281057.1 SP6
 
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12 CTD-2022D21 R 12q23(UCSF)
chr12 102Mb     B81212.1 ,
AQ228650.1 T7,
B65530.1 ,
AQ226207.1 SP6
 
12 CTD-2057C13 C 12q23(FHCRC)
12q23(UCSF)
chr12 101Mb     AQ233841.1 T7,
AQ234093.1*u SP6
 
12 CTD-2269L19 R 12q23(UCSF)
        AQ767354.1*u SP6,
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chr12 105Mb   SHGC-10802 AQ388109.1 SP6,
AQ388125.1 T7
 
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chr12 97Mb AC011248.8 N51014 B82371.1 SP6  
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12q23.1d~23.2a(NCI)
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12 RP11-252C8 C 12q23(FHCRC)
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chr12 106Mb AC009771.22   AQ536046.1 SP6,
AQ536048.1 T7
 
12 RP11-394J1 C 12q23(FHCRC)
chr12 95Mb AC008149.14      
12 RP11-3E2 C 12q23(FHCRC)
chr12 103Mb   SHGC-9125    
12 RP11-478G16 C 12q23(FHCRC)
chr12 101Mb AC069227.24   AQ634610.1 SP6,
AQ634616.1 T7
 
12 RP11-490G8 C 12q23(FHCRC)
chr12 94Mb AC018475.32      
12 RP11-490H24 C 12q23(FHCRC)
chr12 102Mb AC078819.24 RH52765, RH39748 AQ635493.1 T7  
12 RP11-511H9 C 12q23(FHCRC)
chr12 100Mb AC063950.37      
Chr clone name Distributor1 FISH Placement on genome2 Placement summary3 Insert sequence4 STS4 BAC-ends4 Flag
12 RP11-51K17 C 12q23(FHCRC)
chr12 100Mb   SHGC-12629 AQ052653.1  
12 RP11-5O2 C 12q23(FHCRC)
chr12 102Mb   RH52553, 40742*u    
12 RP11-64J11 C 12q23(FHCRC)
chr12 95Mb   SHGC-17530 AQ238671.1 SP6,
AQ238672.1 T7
 
12 RP11-69E3 C 12q23(FHCRC)
chr12 94Mb   SHGC-9625 AQ267489.1 SP6,
AQ267490.1 T7
 
12 RP11-778N14 C 12q23(FHCRC)
chr12 93Mb AC011598.33 RH39735 AQ461816.1*u T7  
12 RP11-79K8 C 12q23(FHCRC)
chr12 96Mb     AQ283161.1 SP6,
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chr12 103Mb   SHGC-9125 AQ282746.1 SP6,
AQ282749.1 T7
 
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chr12 107Mb AC011596.27 H15111*u    
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12 RP11-3P19 C 12q23~24.1(FHCRC)
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12 CTD-2003I23 C 12q23~24(UCSF)
12q24.2(FHCRC)
chr12 110Mb     AQ224188.1 SP6,
B55733.1 SP6
 
12 CTD-2213J8 R 12q23~24(UCSF)
        AQ758631.1*u T7,
AQ758692.1*u SP6
 
12 RP11-690J15 R 12q23.1b~23.1c(NCI)
chr12 96Mb AC007297.23 D12S1671 AQ438604.1 SP6,
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12 RP11-482D24 R 12q23.3b~23.3c(NCI)
chr12 105Mb AC079385.18 D12S1342 AQ631392.1 T7  
12 RP11-90N16 R 12q23.3c(NCI)
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12 RP11-951I11 R 12q23.3d(NCI)
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12 CTB-44H10 R 12q24.1(CSMC)
      AFMA219ZG5*u, D12S1616*u    
12 CTD-2035H5 C 12q24.1(FHCRC)
           
12 RP11-110L13 C 12q24.1(FHCRC)
chr12 105Mb   SHGC-9482 AQ319014.1 T7,
AQ350774.1 SP6
 
12 RP11-3E7 C 12q24.1(FHCRC)
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12 RP11-451A12 C 12q24.1(FHCRC)
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12 RP11-110J12 CR 12q24.1~24.2(FHCRC)
12q24.23a(NCI)
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12 RP11-490B9 C 12q24.3(FHCRC)
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12 RP11-69L19 C 12q24.3(FHCRC)
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chr12 124Mb   D12S837*u CL423337.1 T7,
CL423332.1 SP6
 
12 RP11-284P8 C 12q24.32(FHCRC)
chr12 125Mb   SHGC-2111    
12 RP11-60M19 C 12q24.32(FHCRC)
chr12 128Mb     AQ194617.1 ,
AQ194610.1
 
12 RP11-78D24 C 12q24.32(FHCRC)
chr12 127Mb   SHGC-20795 AQ286589.1 SP6,
AQ286590.1*u T7
 
12 RP11-89F23 C 12q24.32(FHCRC)
chr12 129Mb     AZ517761.1 T7  
12 RP11-89J2 C 12q24.32(FHCRC)
chr12 124Mb   SHGC-2134 AQ286533.1 T7,
AQ286532.1*u SP6
 
12 RP11-205M16 R 12q24.32b(NCI)
chr12 125Mb AC020640.18   AQ419920.1*u T7  
12 RP11-526P6 R 12q24.32b~24.32c(NCI)
chr12 126Mb AC025160.29 D12S1675    
12 RP11-553M19 R 12q24.32c(NCI)
chr12 127Mb   D12S1697*u CL423195.1 SP6,
CL423200.1 T7
 
12 RP11-112B19 R 12q24.32c~24.33a(NCI)
chr12 129Mb AC026764.26 SHGC-2137, D12S343 AQ312982.1 SP6,
AQ343200.1*u T7
 
12 CTB-14F22 R 12q24.33(CSMC)
chr12 129Mb   D12S343    
12 CTB-1H20 R 12q24.33(CSMC)
chr12 128Mb   AFMA064XG9    
12 RP11-119J21 C 12q24.33(FHCRC)
chr12 129Mb   SHGC-2137 AQ341140.1 T7  
12 RP11-1K22 C 12q24.33(FHCRC)
chr12 129Mb AC024021.3 SHGC-4144*u    
12 RP11-394D10 R 12q24.33c(NCI)
chr12 132Mb   G64709 CL423234.1 T7,
CL423230.1 SP6
 
12 CTB-19A11 R 12qtel(CSMC)
chr12 128Mb   D12S97    
12 RP1-221K18 12qter(UChicago)
           
total386C:231 R:154 S:2386364 181233240 

1 Distributor: C, Children's hospical Oakland research institute; R, Research Genetics; S, Sanger Center

2 Placement of clones on the genome. Only clones that are localiized to one or two places on the same chromosome on the draft sequence are included

3 Placement summary indicates sequences used for clone placement.
   BAC-end sequence aligned in the plus orientation
   BAC-end sequence aligned in the minus orientation
   insert sequence
   STS aligned
   insert sequence has clone end information.

4 Sequence-tag

  *d indicates sequences that disagree with placement on the genome.

  *u indicates seqeunces that didn't align to the genome or were not used for annotation because the clone was placed to multiple locations on the human genome.